Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 FAM90A27P-201ENST00000593323 1370 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 FAM90A28P-202ENST00000597191 1374 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 NPL-205ENST00000367555 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 EEF1GP2-201ENST00000509352 1243 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 NPLOC4-214ENST00000573876 560 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC244154.1-201ENST00000620148 1555 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 NDUFB11-201ENST00000276062 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SIRPG-205ENST00000381583 1383 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
GAPVD1Q14C86 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GAPVD1Q14C86 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms