Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PIK3CDO00329 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms