Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC010677.1-201ENST00000441690 412 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 RPL18P1-201ENST00000497218 552 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC007992.1-201ENST00000513953 953 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 SNCG-202ENST00000372017 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC103706.1-201ENST00000561761 679 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 TMEM107-201ENST00000316425 756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 RRNAD1-211ENST00000524343 459 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AL353997.3-201ENST00000586597 589 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
XIRP2A4UGR9 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 MYL7-201ENST00000223364 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 RPL21P135-201ENST00000442539 791 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC025165.4-201ENST00000602327 433 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 AC010531.7-201ENST00000602665 465 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
XIRP2A4UGR9 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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