Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LRRC57-201ENST00000323443 7351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
XCL2Q9UBD3 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms