Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC108082.1-201ENST00000510857 331 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 IFI27L1-205ENST00000554544 406 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SMARCA4P51532 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 UCMA-202ENST00000463405 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC005154.1-227ENST00000579174 755 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 RPL26-206ENST00000582556 763 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AL731555.1-201ENST00000634547 1259 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 KCNE3-202ENST00000525550 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC104423.1-201ENST00000591742 728 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 CENPK-215ENST00000514814 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 TSPEAR-AS2-201ENST00000330490 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC096677.3-201ENST00000413162 387 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC025257.1-201ENST00000550926 375 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AL592146.2-201ENST00000565388 444 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 CCT8-211ENST00000540844 1927 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMARCA4P51532 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms