Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYT1P21579 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GK-203ENST00000378943 3707 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SYT1P21579 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYT1P21579 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms