Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 APTX-203ENST00000379813 1121 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SLC25A6P1-201ENST00000412123 775 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CNTFR-AS1-201ENST00000436360 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CNTFR-AS1-203ENST00000453642 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 APTX-220ENST00000476858 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC013356.4-201ENST00000558421 482 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 RPSAP67-201ENST00000584105 862 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC010615.2-201ENST00000596705 566 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ALOX15P2-201ENST00000340858 1897 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC004771.1-201ENST00000438266 583 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 OR5BA1P-201ENST00000529722 982 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 DEGS2-202ENST00000553834 421 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 MAS1LP1-206ENST00000419416 1047 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 GAPDHP65-201ENST00000425487 1006 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 P2RX6P-202ENST00000450626 357 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 UCMA-202ENST00000463405 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 PSMG3-AS1-207ENST00000612019 586 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFTRP13569 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 AC004471.2-201ENST00000609936 1514 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFTRP13569 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFTRP13569 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFTRP13569 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CFTRP13569 AC140481.1-202ENST00000436488 525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFTRP13569 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFTRP13569 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFTRP13569 AC080038.2-201ENST00000617734 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CFTRP13569 AL137028.1-201ENST00000620521 555 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CFTRP13569 AC130469.2-201ENST00000625112 1092 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CFTRP13569 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFTRP13569 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFTRP13569 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFTRP13569 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFTRP13569 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFTRP13569 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFTRP13569 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFTRP13569 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFTRP13569 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFTRP13569 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CFTRP13569 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms