Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PCNAP12004 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNAP12004 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNAP12004 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PCNAP12004 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PCNAP12004 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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