Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
USP35Q9P2H5 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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