Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
NICN1Q9BSH3 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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