Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ZNF701-204ENST00000540331 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 RNGTT-202ENST00000369485 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 TUBGCP4-208ENST00000564079 6798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 RBM8A-204ENST00000583313 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
ERVK-16P61578 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms