Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PIP4K2AP48426 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms