Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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HOXA3O43365 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HOXA3O43365 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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