Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVV-2B6SEH9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVV-2B6SEH9 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms