Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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