Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
DKK2Q9UBU2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms