Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms