Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RASA1P20936 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms