Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 DNM1L-220ENST00000549701 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AL049597.1-201ENST00000447415 555 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 RN7SL452P-201ENST00000482923 291 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 SNORD55-201ENST00000581525 80 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 AL512488.1-201ENST00000433544 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOP2AP11388 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms