Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FRMD3A2A2Y4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms