Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 LINC00424-201ENST00000413124 654 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 IQCF4-203ENST00000428561 420 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AL358115.1-202ENST00000455257 675 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PCDH10Q9P2E7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PCDH10Q9P2E7 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PCDH10Q9P2E7 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PCDH10Q9P2E7 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RN7SKP52-201ENST00000516219 250 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC090772.3-201ENST00000583267 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC020663.2-201ENST00000592465 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PCDH10Q9P2E7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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