Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AL512422.2-201ENST00000426453 551 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 AL109983.1-201ENST00000603234 646 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 BIN3-212ENST00000640731 450 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 AC006511.4-201ENST00000631571 561 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTF1AQ7RTS3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PTF1AQ7RTS3 FKBP4P1-201ENST00000507284 1347 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms