Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SRSF5Q13243 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms