Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 WNT16-202ENST00000361301 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 C3orf52-204ENST00000480282 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC074051.4-201ENST00000564888 892 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AL513327.1-204ENST00000630229 870 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PSEN1P49768 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms