Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL096817.1-201ENST00000623904 1775 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PTPRG-201ENST00000295874 4650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DCUN1D3-202ENST00000563934 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
VPREB1P12018 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms