Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103876.1-203ENST00000565495 290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFI27L1-203ENST00000553664 647 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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BIVM-ERCC5R4GMW8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
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BIVM-ERCC5R4GMW8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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BIVM-ERCC5R4GMW8 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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BIVM-ERCC5R4GMW8 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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BIVM-ERCC5R4GMW8 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 BNIP1-203ENST00000352523 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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BIVM-ERCC5R4GMW8 ROM1-205ENST00000534093 862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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BIVM-ERCC5R4GMW8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3-66-201ENST00000390632 427 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01606-208ENST00000521653 557 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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