Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COG3Q96JB2 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COG3Q96JB2 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms