Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 RP1-207ENST00000637698 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSR1Q2NL82 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms