Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ITGAEP38570 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms