Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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HOXD10P28358 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXD10P28358 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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HOXD10P28358 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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HOXD10P28358 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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HOXD10P28358 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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HOXD10P28358 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 SRP9P1-201ENST00000445874 261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXD10P28358 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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