Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 OOEP-201ENST00000370359 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 SLC22A18AS-201ENST00000455942 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 DERL1-204ENST00000519018 575 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC244102.2-201ENST00000597568 955 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DMDP11532 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 TRPC3-205ENST00000513531 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC103706.1-201ENST00000561761 679 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 LINC02074-201ENST00000581028 569 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 LINC02074-202ENST00000584003 573 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DMDP11532 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DMDP11532 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DMDP11532 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DMDP11532 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DMDP11532 NBR2-202ENST00000460115 1344 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DMDP11532 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 IGHV3-60-201ENST00000521678 354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 FAM86B1-215ENST00000533513 725 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 GNLY-201ENST00000263863 846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DMDP11532 SNHG11-211ENST00000444816 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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