Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms