Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HDAC6Q9UBN7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDAC6Q9UBN7 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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