Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 FAM25A-201ENST00000343959 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
LTBRP36941 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AP002852.2-202ENST00000523572 592 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 ABCC6P2-201ENST00000526069 590 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LTBRP36941 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBRP36941 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBRP36941 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBRP36941 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LTBRP36941 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms