Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 BACE1-207ENST00000510630 1236 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AL391903.1-201ENST00000407513 365 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC138392.1-201ENST00000427577 921 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms