Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GABPAQ06546 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms