Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 KCNK10-202ENST00000319231 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GNPDA1-210ENST00000508177 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GEMIN5-201ENST00000285873 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SH3BGRP55822 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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