Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRE11P49959 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MRE11P49959 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MRE11P49959 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms