Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
POLD1P28340 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD1P28340 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD1P28340 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD1P28340 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD1P28340 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AL049792.1-201ENST00000424708 1262 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 HNRNPA1P11-201ENST00000580106 956 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
POLD1P28340 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RBMXP1-201ENST00000408004 1191 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 OSGIN1-206ENST00000565123 833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
POLD1P28340 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms