Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 POU2F2-216ENST00000560558 3282 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 NT5C3A-214ENST00000620705 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ZNF506-203ENST00000540806 1424 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ANKRD30BL-202ENST00000409867 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AL359541.1-201ENST00000431097 575 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 CREM-237ENST00000488328 1049 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 BRIX1P1-201ENST00000521785 908 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AP4S1-206ENST00000554609 1012 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 LINC02152-201ENST00000566208 1281 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 Z99289.1-201ENST00000585373 807 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HOXB1P14653 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms