Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SLC3A1-205ENST00000409387 2334 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SFTPCP11686 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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