Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KIF4AO95239 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KIF4AO95239 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms