Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 VANGL1-201ENST00000310260 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
DENRO43583 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 MMP19-206ENST00000548629 1813 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 USP11-204ENST00000377107 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 MB21D1-201ENST00000370315 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 RPS10P7-201ENST00000441932 2329 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
DENRO43583 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms