Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAPN6Q9Y6Q1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAPN6Q9Y6Q1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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