Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCYT1BQ9Y5K3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCYT1BQ9Y5K3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms