Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00588Q9Y4M8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00588Q9Y4M8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms