Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POMPQ9Y244 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POMPQ9Y244 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POMPQ9Y244 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POMPQ9Y244 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POMPQ9Y244 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POMPQ9Y244 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POMPQ9Y244 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POMPQ9Y244 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POMPQ9Y244 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
POMPQ9Y244 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POMPQ9Y244 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
POMPQ9Y244 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.33■■□□□ 1
POMPQ9Y244 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POMPQ9Y244 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POMPQ9Y244 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POMPQ9Y244 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POMPQ9Y244 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POMPQ9Y244 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
POMPQ9Y244 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
POMPQ9Y244 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POMPQ9Y244 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POMPQ9Y244 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POMPQ9Y244 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POMPQ9Y244 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POMPQ9Y244 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POMPQ9Y244 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POMPQ9Y244 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
POMPQ9Y244 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMPQ9Y244 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMPQ9Y244 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POMPQ9Y244 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POMPQ9Y244 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMPQ9Y244 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMPQ9Y244 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
POMPQ9Y244 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMPQ9Y244 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMPQ9Y244 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMPQ9Y244 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMPQ9Y244 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMPQ9Y244 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMPQ9Y244 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POMPQ9Y244 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POMPQ9Y244 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POMPQ9Y244 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POMPQ9Y244 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POMPQ9Y244 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
POMPQ9Y244 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POMPQ9Y244 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POMPQ9Y244 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POMPQ9Y244 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POMPQ9Y244 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms