Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HIGD1AQ9Y241 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms