Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF3IP3Q9Y228 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms