Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH4Q9UQ05 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH4Q9UQ05 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms